這些變化將把目前的結構從現在的430個關稅減少到60個以下，并專注于船舶運力和每次過境的固定關稅。根據巴拿馬運河管理局的一份聲明，船舶還將根據使用的船閘不同，支付不同的費用。

　　例如，一艘通過巴拿馬運河擴建的船閘運輸46,000噸丙烷的液化石油氣船，到2025年每噸將多支付5.20美元，約占每個單位最終市場價格的0.9%。

　　聲明稱，通過原始船閘運載450,000桶原油的油輪每桶將上漲0.20美元，最終市場單價將上漲0.4%。

　　汽車運輸船、化學品和液化天然氣油輪以及運載谷物和煤炭等散貨的船舶也將面臨更高的關稅，對市場價格造成約0.1%至0.7%的影響。

　　2019年5月15日，集裝箱船“MV Triton”號成為通過擴建的巴拿馬運河上最大一艘船舶。

　　據悉，調整過后受影響最大的部分將是客船和集裝箱船。一艘擁有2,200個位置的客船通過原始的一套船閘，每人的總費用將增加77美元，每位乘客的最終票價將增加約4%。

　　集裝箱船是巴拿馬運河的最大客戶，與目前的通行費相比，將上漲約8%。

　　根據巴拿馬運河管理局的數據，到2025年，一艘載有9,000個集裝箱并裝載90%容量的集裝箱船通過擴建的船閘，每個集裝箱的總費用將增加6美元。

　　巴拿馬運河管理局將于5月20日在巴拿馬舉行有關變更收費系統的公開聽證會，并將在5月17日之前審議通過電子郵件發送的反饋意見。一旦獲得批準，新的收費系統將在2023年1月至2025年期間逐步實施。